Caractérisation des facteurs de virulence chez Golovinomyces ambrosiae, agent pathogène responsable de la maladie du blanc  ​

Affectant plus de 10 000 espèces à travers le monde, la maladie du blanc est l’une des plus communes chez les plantes. Parmi la multitude d’agents pathogènes fongiques pouvant causer la maladie, Golovinomyces ambrosiae affecte plusieurs hôtes d’importance agronomique du secteur ornemental ainsi que le chanvre. La colonisation du mycélium en surface des organes aériens affecte directement la qualité des produits à commercialiser, pouvant mener à leur déclassement complet. 

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Il est largement reconnu que la lutte par des approches génétiques, basée sur l’exploitation de gènes de résistance (NLR) chez la plante est la solution la plus optimale pour contourner la maladie. Celle-ci repose sur un principe d’interaction gène pour gène, stipulant qu'un gène de résistance chez la plante empêche l'apparition de la maladie uniquement si l’agent pathogène est porteur d’un gène d'avirulence (Avr) spécifique. Par conséquent, l’identification des gènes Avr est cruciale pour valider l’efficacité des différentes sources de résistance chez l'hôte. Par l’assemblage et l’annotation du premier génome de G. ambrosiae, le projet vise à identifier et caractériser l’ensemble des gènes d’avirulence candidats chez l’organisme. Par l’analyse génomique de différentes souches de l’agent pathogène, la diversité génétique de ces gènes sera également étudiée. Les données générées par ce projet seront essentielles pour décrypter différentes interactions moléculaires NLR-Avr, permettant, en contexte pratique, de connaitre quel gène de résistance est exploitable en fonction de la souche de l’agent pathogène présente dans l’aire de culture.